因为夺妻之恨，亲王从此以后，就是大政奉还和武力倒幕的坚定支持者。
禁门之变前2个月前的元治元年（1864年）5月、炽仁亲王和帜仁亲王父子在天皇召开的国事会议上，站在攘夷派的立场上、和幕府派的京都守护松平容保対立。
由于炽仁亲王是汉学者大沢晩翠的弟子，通过亲信古高俊太郎和勤王派的长州藩士迅速接近，他的宫邸成为桂小五郎和久坂玄瑞等人自由出入之地。
后来禁门之变的时候、据说进击御所的长州兵是有栖川宫家指引的，一时间谣言四起，他被京都奉行所以违背宫家诸太夫法度逮捕、拘禁。孝明天皇盛怒之下罢免了他们父子的进宫议事资格，勒令他们闭门思过。
庆応3年（1867年）1月、和幕府友好的孝明天皇突然无故死去。15岁的明治天皇践祚、帜仁亲王、炽仁亲王父子禁令解除。10月恢复了职务、取代主张和幕府友好的青莲院宫尊融亲王和二条齐敬主持政务、同年12月9日、王政复古大号令下新设総裁议定参与三职，和长州关系良好的炽仁亲王出任総裁。成为幕府方面的领导。
炽仁亲王虽然身份显赫，地位崇高，但是实际工作能力都有欠缺。好在他头脑清醒，从没想过要把一切权力都抓在手中，鞠躬尽瘁、事必躬亲。他劝说明治小天皇下旨，启用了一大批以前被排斥的朝廷公卿。其中，有两位极其重要的人物：三条实美、岩仓具视。
不久（1868年2月2日），这二人就被任命为副总裁。自从有了这两大干才做帮手，炽仁亲王就此放心省力的去当甩手大掌柜，具体事务全都交给二人操作。
这一年，三条实美31岁，岩仓具视43岁。庆応4年（1868年）戊辰战争爆发，有栖川宫炽仁亲王出任官军的最高司令官，东征军大総督。参谋就是西乡隆盛，负实际指挥责任，官军向江戸进撃、最后以江戸城无血开城而大获全胜。
明治2年（1869年），有栖川宫炽仁亲王去欧洲视察、翌明治3年（1870年）归国。就任兵部卿。明治4年（1871年）福冈藩知事工作、明治9年（1876年）就任元老院议长。
明治10年（1877年）西南战争爆发，再次出任征讨大总督、指挥官军和西郷隆盛対峙。
有栖川宫炽仁亲王是明治皇族第一人，受到明治天皇的绝对信任。
日本政府虽然有英国和法国的扶持，但也不能承担借款太巨大的压力，加上国力弱小，所以，明治天皇喊出了这次要同华军决战的口号。
这多大军当中，就包含了一支5000人的天皇禁卫军，清一色更换了刚从欧洲运回来的施奈德-恩菲尔德步枪，这支军队参加了天皇重新执政后的各次战争，经验丰富，装备精良，最是忠诚。
“你们都是帝国能征善战的勇将，为什么凭着十倍于敌兵的优势，却屡战屡败？”有栖川宫炽仁亲王在全体军官的大会上生气道：“我们有本土优势，有人数优势，华军有武器装备的优势，有训练有素的优势，为什么你们在战前不会分析敌我的态势？不会分析敌我的优劣，一次次站着原地，让人家砍到头上来？”
有栖川宫炽仁亲王虽然不是将才，也不是帅才，能力很平庸，但是在战略上，在大事的眼光上还是很不错的，不然也不会得到明治天皇绝对的信任。
听了有栖川宫炽仁亲王的话，在场的一百多名日本军官都惭愧的低下了头。
“我就说这么多，不是要给大家增加压力，但是现在日本已经到了最危难的时刻，你们心里不会不清楚吧？如果九州岛被华国长期霸占，我们的版图将缺失一块，而且九州岛在整个日本的经济中占有很重要的作用，超过了四分之一，长崎更是日本最早开关贸易的重要港口！日本不能实际统一，加上华军的牵制，经济发展的速度会放缓，军队建设的速度也会放缓，而庞大的华夏帝国早已经实际统一，并且正在开疆拓土，到时候，我们日本和华国的差距会越拉越大，到时候，当华军大兵压境之时，就是在座的诸位国破家亡之时！”有栖川宫炽仁亲王说完，气愤的坐了下来，示意山县有朋发言。
山县有朋沉重着嗓音道：“亲王殿下的话，大家都听到了，亲王说的危难局面，我相信在座的每个人都很清楚，前次的失败，我应该承担主要责任，是我没有根据华军的情况制定出有效的办法，我本想破腹向天皇谢罪，但是战争没有结束，正是用人之时，我只能暂时按捺下向天皇陛下谢罪的心思。这一次，我和参谋本部一起制定出了新型的战法，一定要发挥出我军人数多，本土作战的优势！这就是新型的钳形攻势！”
随着山县有朋的话，众军官一阵快速的互看，钳形攻势的说法，显然很新鲜。
山县有朋在地图上标出了华军现在的位置，还有日本政府军集结的位置，用小日本国旗来标识出即将运行的位置和方向。
“将军，华军擅长分割包围，这么做的话，可能会演变成运动战，这正是华军的强项啊。”一名军官质疑道。
山县有朋一抬手，“过去的站桩式打法，显然已经适应不了现在的作战需求了，华军会运动，我们凭什么不能运动？”
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