主角开始招募人手，又拉着霍华德创立通讯公司，接着和至尊法师古一见面，并进行交谈，接受任务，驱逐征服者康。
主角招募变种人，其中包括金刚狼兄弟，海王纳摩来袭，主角出击，击败纳摩，击杀北海巨妖。
纳摩发动宫斗清洗，美队加入神盾局，亚特兰蒂斯和神盾局双方都在准备战争，主角通过佐拉博士加入九头蛇，准备成为唯一的掌控者。
亚特兰蒂斯对北美发起攻击，主角拉着古一见证自己的神盾局应对措施，神盾局的出击让亚特兰蒂斯进攻频频受阻。
亚特兰蒂斯发起和谈，随后谈判失败，纳摩在塞巴斯蒂安-肖的怂恿下，决定启动行星级武器，古一和主角进行交流。
主角发现行星级武器是天神的盔甲，接着在古一帮助下将其带走，重创纳摩，击杀塞巴斯蒂安-肖。
主角说服白皇后，晋升中将，接着金刚狼兄弟完成改造，征服者康降临，幻化为总统。
主角召开和平峰会，救了霍华德，遇到了吸血鬼，接着得到吸血鬼和狼人的效忠。
主角得知征服者康降临的消息，又在卡玛泰姬翻阅魔法书籍，学习了魔法。
主角开始调查，发现征服者康可能在白宫，将尼克-弗瑞收入神盾局，通过调查确定征服者康的身份。
主角主动出击，降临白宫，和征服者康组建的反超人联盟大战，与维度魔神西索恩短暂对峙。
主角击杀征服者康，通过飞船前往宇宙，来到未来世界，这个世界刚被灭霸打了响指。
主角找到古一，接受任务，帮助复仇者把世界恢复正规。
主角击败托尔，找到幸存的复仇者联盟，告诉大家自己的计划，找回了钢铁侠。
众人找到灭霸，因为主角提早介入剧情，剧情发生改变，灭霸没有失去无限宝石，并看到了自己的未来。
复仇者们与灭霸交战，接连失败，主角出手，灭霸不敌，被迫打了响指，随后灭霸死去。
主角打了响指，恢复了被灭霸消灭的一半生命，接着复联的科学家做好了穿梭宇宙的通道，主角带着雷神索尔和浣熊火箭出发。
主角三人被斯特兰奇召唤出来，至尊法师争霸赛即将开始，主角开始给未来的至尊法师进行特训。
主角一行人见到女版洛基，接着索尔成为洛基的契约者，斯特兰奇通过第一轮试炼，主角和墨菲斯托见面。
第二场试炼开始，主角出场，快速通过第二试炼，接着第三试炼开始，这场的目的是拯救。
斯特兰奇带着主角前往地狱，和墨菲斯托进行谈判，接着主角出手，帮助斯特兰奇拿到灵魂契约，完成试炼。
主角接替至尊法师，成为至尊超人，获得X金属，接着再次返程回家。
凶兆先生和只剩一个大脑的征服者康合作，对美队和霍华德发起追杀，接着主角回归。
主角引导了一场游行，随后将其制止，击杀凶兆先生，又解决掉征服者康，康在临死前将主角传送到埃及。
天启复活，和主角交手，随后不敌退走，随后天启开始发展信徒。
主角发现博见部，跟着他们找到埃及公主，召唤死神赛特，掠夺了其的权柄，成为新的死神。
主角开的变种人学院步入正轨，年轻的X教授等人纷纷入学，接着主角和美队前往苏联。
主角和美队带走了巴基，收编九头蛇分部，接着在拉斯维加斯发现墨菲斯托，二人达成合作。
天启与凤凰大战，随后战火波及到拉斯维加斯，主角出手，和天启大战，最后将自爆的天启塞进凤凰体内。
凤凰之力大扩散，凤凰信徒批量出现，美队举行婚礼，万磁王诞生。
黑皇后救出海王纳摩，纳摩像主角举报她，随后主角将二人收入神盾局，接着万磁王被送进校园。
主角接受维山帝的委托，前往91宇宙，得知大蛇库尔苏醒，主角和复仇者联盟进行沟通，告知天锤尊者的事。
奥丁试图毁灭地球，主角带着索尔出现，摧毁彩虹桥，和奥丁大战。
二人连续击穿八个世界，降临南极，主角击败奥丁，将奥丁和库尔关在一起。
主角给两个索尔发布任务，随后召集九界联军，前往南极，和库尔的尼伯龙根军团交手。
哨兵出场，暴揍了库尔，随后和主角大战，二人在外太空交战，最后主角击杀哨兵，虚无出现。
主角和虚无的战斗余波轰爆冥王星，二人交战转移到太阳，接着同归于尽。
主角回归冥府，用第十金属强化自己，见到了五大神明之一的死亡女士，接受了新的任务。
闪电侠重启宇宙，主角抽奖，获得超级氪星人骇尔模板，索尔击杀了库尔。
主角穿越次元维度，通过起源之墙，偷渡到DC宇宙，到达天堂岛，见到了神奇女侠戴安娜。
戴安娜跟随主角离开天堂岛，主角发现这个世界是闪点世界，这是一个由于闪电侠拯救了母亲，而扭曲的时空事件。
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