第五节 细菌的分类与命名
1.细菌分类地位
1.1 分类地位：原核生物界
1.2 分类单元：
①细菌分类的层次与其他生物相同，也是界、门、纲、目、科、属、种。
②在细菌种，常用属和种。
1.2.1
属：
①生物学性状相近、关系密切的若干菌种组成一个菌属。
②具有共性的若干种的组合，应与其他属有明显的差异。
③不同属之间的 16S rRNA 序列有较大的差异，但目前尚无量化标准。
1.2.2
种：
①细菌分类的基本单位。生物学性状基本相同的细菌群体构成一个菌种。
②同一菌种的各个细菌，虽性状基本相同，但在某些方面仍有一定差异。
③亚种：同一菌种各个细菌，某些方面仍有一定的差异，可再分成亚种。
型：
①“型”常用于亚种以下的细分。
②是同种之间在某些特殊性质上有区别的细菌。它们之间的区别不像亚种那样显着。
③按抗原结构的不同，可将细菌分成多种不同的血清型。
1.2.3 菌株：
①人们把不同地区或不同实验室分离到的具体菌种称为菌株。
②一旦菌株发生变异，均应标上新的菌株名称。
③当进行菌种保藏，筛选或科学研究时，在进行学术交流或发表论文时，在利用菌种进行生产时，都必须同时表明该菌种及菌株名称。如：DH5a 菌株、BL21（DE3）菌株等。
2.细菌的命名
①命名原则：据国际细菌的命名法规，采用拉丁文双名法。
②每个菌名由两个拉丁字组成。前一字为属名，用名词，第一个字母大写后一字为种名，形容词，第一个字母小写。
③一般属名表示细菌的形态或发现或有贡献者，种名表明细菌的性状特征、寄居部位或所致疾病等。
④整个属名和种名在出版物中应排成斜体。
⑤中文的命名次序与拉丁文相反，是种名在前，属名在后
eg： Staphylococcus aureus（属名 种名）
金黄色葡萄 球菌（种名 属名）
Escherichia coli（属名 种名）
大肠埃希菌（种名 属名）
3.细菌分类鉴定的标准
①按表型特征分类法（陈旧培养基会使性状发生改变）。
②种系发生关系鉴定
（1）测定 DNA 中（G+C）mol%
（2）核酸杂交法
（3）16s RNA 寡聚核苷酸序列
4.细菌的分类方法：
①条目分类法
②数值分类法
5.细菌的分类体系
①《伯吉氏系统学手册》
②《原核生物》
③国际系统与进化微生物学杂志（IJSEM）。
④国际着名的菌种保藏机构。
6.细菌的鉴定
①先获得细菌纯培养物，明确其是否具有致病性，若是致病菌及时做药物敏感试验。
②鉴定一般采用形态学观察作初步鉴定，含革兰染色，荚膜，鞭毛，运动性观察等。
③然后进行生化试验、血清学试验作进一步鉴定。
④也可进行 16S rRNA 序列扩增测序，将测到的序列与 GenBank 中已知的细菌序列相比较，根据亲缘关系远近最终确定种属。一般来说，90%以上的同源性就可确定到属，确定到种的可能性很小。
病料采集 （涂片、染色、镜检）
↓
分离培养（观察培养特征、涂片、染色、镜检）
↓
纯培养
↓
动物试验（药感试验、培养特性、生化试验、血清学试验、分子生物学方法）
第六章 革兰阳性球菌
球菌种类
按革兰染色特性分为：①革兰阳性球菌 ②革兰阴性球菌
兽医临床上重要的是革兰阳性球菌。
其中葡萄球菌属（产物有些引起中毒）和链球菌属的某些成员是人和动物的重要致病菌。
第一节 葡萄球菌属
一、概述
二、生物学性状
三、分类（记住某一种菌哪一血清型对动物有致病性，猪瘟病毒就一个血清型）
四、致病性（最重要！掌握其导致什么疾病）及毒力因子
基本思路：某一病→哪一类可能致此病→联系部位→进一步诊断
↓
分细菌和病毒，思考细菌和病毒各有几类可至此病。
需掌握：此类病毒有一个还是多个血清型，哪些比较常见或对动物致病性强，
→哪一种型疫苗进行防治
五、微生物学诊断
①疾病菌核酸测序：测序系列与病原系列进行比对→同源性高才可以做进一步鉴定。
②掌握每个病毒最主要的病毒因子，及哪些致病集团+相关蛋白。
1.概述
①葡萄球菌属是一群革兰氏阳性球菌，因常堆聚成葡萄串状，故名。
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