（提前提醒一下，原本生化危机7的剧情时间线是在生化危机世界的2017年发生的，所以我进行改变了一下，将时间提前了三年也就是2014年就开始，以下将以生化危机7主角伊森的视角展开。）
在生化危机6的剧情结束后，世界再一次恢复了平静，卡拉和西蒙斯建立的新安布雷拉也再一次付之东流，可是随着新安布雷拉的消亡。
在米利坚政府高层的主导之下，根据《企业重组法案》原保护伞公司美国分支资产重组，保护伞公司再次复生。不过不同的是将标志从红色改为蓝色，因此人称“蓝色保护伞公司”。
由于BSAA不像B.S.R.F这般独立，所以作为创始人的克里斯也开始遭到排挤，由于这次处理泰城和高橡树市时表现不佳，BSAA也开始被加入了反生化联盟的成员国质疑能力。
于是在米利坚的提议下BSAA开始与蓝色保护伞公司展开了合作。
.就在世界各国都认为和生化有关的事情都不会再发生的时候，但事情却往往不按他们的期望来发展。
因为就在十几年前也就是2000年，神亚公司开展了NEXBAS这一项目，其中一个子项目的内容是联合H.C.F.研发生化武器。期望以最小的直接接触消灭大量的敌人。
后来，NEXBAS项目遭到取消，其所有的资产转移到了研发生化武器这一子项目上。
该子项目研发的生化武器与一般武器不同，能够令敌人变成盟友，使敌军从内部开始分裂。
该项目很快便得到了大量支持，而其研发的核心便是一种菌类，通称为“mutamycete”。
研究生物武器的方法很简单，即是将mutamycete基因组注入人类胚胎并在受控环境中进行培养。
为了方便在以后的战争中混入敌方的城市，这些胚胎统一选择年龄在10岁左右的女孩们。
这些女孩被研究人员称为“候选标本”，顾名思义，就是在这些女孩中测试并选择具有强大功能的个体。
这些被作为生物武器而研究的女孩后来经过可用性分级，从不实用的缺陷品到功能强大的完成品，一共分为A、B、C、D四个系列。
而在此之上，还有着超越了D系列的，其能力堪称完美的E系列。
而第一个E系列标本的名字，便叫做：E-001，伊芙琳。
2011年，伊芙琳所在的研发公司接到情报，公司的敌人已经发现了伊芙琳的存在，为了确保这一强大的生化武器不会落入敌手，公司决定紧急转移伊芙琳。
为了不引起敌人的注意力，这次的任务仅仅派遣了两个人，他们分别是特别行动处的主管艾伦以及看守员米娅。
由于米娅身为看守人员，本身已经与爱人伊森结婚，然后这次的护送任务又牵扯到公司的高度机密，在伊森面前，米娅始终谎称自己的工作是保姆。
经过公司计划，艾伦与米亚伪装成伊芙琳的父母，一行三人以货船船长亲戚的身份，于2011年10月登上货船，前往转移地点。
然而在10月5号这天，伊芙琳突然攻击并感染了艾伦，之后暴走的伊芙琳摧毁了货船并屠杀了船上所有的人，而米娅在阻止她的过程中遭受重创，失去了其作为看守员的记忆。
这一天风雨交加，波涛汹涌，货船因为引擎被毁随波漂流数天，最终在10月9日被冲到了河口。
2011年10月9日，卢卡斯·贝克告诉自己的父亲杰克·贝克有一艘船被冲到了河口。
2011年10月10日，杰克·贝克去河口查看情况，发现了伊芙琳与已经失去记忆的米娅。
2011年10月10日，杰克再从自己的儿子口中听说有艘船被冲到了河口，杰克一大早就去了那边，玛格丽特在家中等候丈夫归来。
然而事情的发展有些出乎意料，当敲门声响起时，玛格丽特惊讶的发现站在门外的除了丈夫杰克之外，还有一个小女孩与一位受伤的女人。
女孩名叫伊芙琳，受伤的女人神智则有点不清醒，她说自己的名字是米娅。
善良的贝克夫妇悉心地照顾遭遇船难的两个女子，但事情似乎有点诡异。
因为玛格丽特当天就莫名的出现了严重的耳鸣，整天睡不着觉，并且就连自己的女儿佐伊说伊芙琳和米娅有些古怪。
但由于自己的女儿从小就有些离经叛道，玛格丽特自然不会因为她的一句话赶走两人，毕竟她们身为船难得受害者，已经非常可怜了。
10月15日，玛格丽特觉得事情似乎真的很不对劲，因为她不但出现了幻觉，连同耳朵也开始幻听，玛格丽特觉得很恶心，为此她还专门跑去医院拍了X光。
医院方面很快寄来了回信，玛格丽特的脑子里出现了霉菌，医生怀疑贝克夫人的幻觉幻听都来源于此，医生说这个症状关乎生命，请求玛格丽特夫人在收到信后立刻来医院复诊。
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