自从和九尾约定好要好好培养鸣人之后，美琴教会了鸣人踩树，踩水，三身术鸣人也学会了，经过了一段时间的训练，已经炉火纯青，而美琴也提前了4年教会了鸣人多重影分身之术，这个对于鸣人来说，量身打造的外挂。让鸣人这孩子越来越像个忍者了，在学校里虽然文化课鸣人还一如既往的拉之外，但在体术，忍术（忍者学校主要教的就是三身术）以及投掷手里剑苦无这些科目里，鸣人终于不是吊车尾，而是能跟佐助打的有来有回的天才。
先不说鸣人的变化，时间不知不觉经过了半年，在这半年里美琴除了刚开始放假了几天外，很快就开始了暗部的生活，作为火影直属暗部，以护卫火影为主要责任，而美琴是火影护卫队的队长，而三代火影经常借着护卫他为由，让美琴学习怎么处理政务，可把美琴憋坏了，可要让三代发现不了自己要密谋对付他的好徒弟好基友，美琴下了不小的功夫，比如借口学习情报收集分析，或者要震慑外国势力等等，要求与宇智波鼬组队学习，因为他非常优秀。
三代火影只能宠溺的答应了，就这样，美琴一边与鼬组队刷副本，一边收集大蛇丸的情报，在这过程中，美琴与鼬的羁绊越来越深，在通过近距离接触，美琴发现鼬比原着中，心思更细腻，实力更强大，头脑更清晰，火影版的夏洛克福尔摩斯。而鼬在和美琴的接触中发现，美琴就像个大大咧咧的大男孩，一点都没有少女的矜持，会突然就搭肩挽臂，让人猝不及防，甚至还让他不小心碰到少女最柔软的地方，常常让鼬面红耳赤，幸好带着面具，不至于丢人，这半年时间让鼬对美琴产生了不一样的感情与羁绊。
这不能怪美琴，毕竟上辈子遇到好兄弟她都是这样子的，而美琴当鼬是好兄弟，接触下来和鼬一起做任务是真得舒服，不用动脑，而鼬又会照顾人，煮饭烤鱼全是他干，美琴就负责吃（毕竟996的人绝对不会煮饭）。而接触下来，发现鼬好像已经走出了止水的阴影，变得活泼起来！但其实美琴不知道的是活泼是受到她的影响，而当鼬回到宇智波，你就会发现，鼬对宇智波一族的愤怒，一天比一天加重。美琴对此却毫无发觉，只能说鼬是天生的间谍，天生的演员。因此，宇智波最终走向灭亡的结局早已注定，世界意志的收缩线毋庸置疑。
值得一说的是，在一次在火雷边界的任务中，美琴一人逼退云忍上忍8人中忍16人，以1对24逼退云忍的战绩，木叶梦魇之名响彻火影世界。而我们的主人公每次听见“真不愧是木叶梦魇”这句话，都会被这中二的名号给尴尬不已，当然这就是后话了。
说回现在，在系统开地图的情况下，半年时间美琴已经掌握了包括大蛇丸人体实验的所有证据，并且破坏掉几个大蛇丸的实验室，但大蛇丸就像泥鳅一样滑，始终没有人脏并获，但是团藏为大蛇丸提供人体实验材料的证据已经收集成功。现在只要等一个时机，那么回收止水眼睛，并把团藏连根本连根拔起，这样也能拯救像佐井兄弟这样根部的可怜人。
与此同时，团藏在根部基地召见了宇智波鼬。鼬单膝跪地报告道：“团藏大人，宇智波一族已经准备完成，三日后发动政变！”
团藏：“果然如此，宇智波一族就是这样黑暗血腥一族，老夫早就说过宇智波一族早晚会背叛木叶（不就是你团藏搞得鬼吗），可恨那猿飞日斩优柔寡断不肯趁早动手，不过现在也不晚，就由老夫替木叶处理麻烦吧。”
鼬：“团藏大人，佐助并没有参与其中，希望大人能放过佐助，而我会以叛忍之名打入晓组织内部，并全灭宇智波一族，为您提供晓组织情报。”。
团藏：“哼，那老夫答应你不碰宇智波佐助，但你记得晓得情报第一时间跟我汇报，退下吧。”
离开了根部，宇智波鼬出现在离木叶不远处的的树林，而鼬叫住了有一个戴着面具的男人。
“喂，我想请你帮个忙，按照约定协助我毁灭宇智波，你负责警卫队。”
面具男回答道：“我之所以帮你消灭宇智波，除了去复仇之外，我还有其他目的，那些你就装作没看见好了。”
“可以，但你绝不能对宇智波以外的人动手。”
“一言为定，明晚见。”说完神秘面具男消失了。
“止水，明晚一切都会结束了”说完，鼬也消失在森林里。
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