怎料张宗禹捻军往山东虚晃一枪回师皖北，重占雉河集，与苗沛霖声势相联，寿州苗沛霖见太平军势力有所恢复，靠山胜保已死，生怕清廷卸磨杀驴，又与太平军联络举起反清大旗。时清廷急调僧格林沁带骑兵火速攻苗，苗沛霖军首当其冲，双方在蒙城附近大战，苗家军大败，苗沛霖战死，苗家军李万春、赵玉华亦战死，童维翰被擒杀。张宗禹见状，又走山东，僧格林沁尾追而去。
1863年，宋景诗率部辗转返回山东临清，脱离了清军，不久再次扯旗反清，四处游走，与清军周旋。当年10月，被清科尔沁郡王僧格林沁的蒙古骑兵击败，混乱中，宋景诗离队出走，不知所终。
1863年太平天国慕王谭绍光率所部坚守苏州，12月4日在苏州慕王府主持召开军事会议时被叛徒纳王郜永宽、康王汪安钧等刺死，壮烈牺牲。12月6日，郜永宽在李鸿章设的宴席中出席，八人就座后，开始喝起酒来。酒席间，李鸿章让身边的八个武弁手捧红顶花领的武服递呈八人，郜永宽等人正要接受时，武弁们随即拔出腰刀砍杀了郜永宽等八个降将。终于，李鸿章实施了他杀降的行动，接着城内两万多降卒皆屠。
1863年2月，义军弹尽援绝，吴凌云率众突围，“中途遇伏，炮轰伤重”身亡。清军冲入陇罗，大肆烧杀淫掠，陇罗顷刻间被夷为平地，吴凌云领导的延陵国起义，归于失败。其子吴亚忠率领余众突出重围，向桂西北转移。他转战于归顺州城西北，屯扎于三台山。灵山农民军小张三前来会合。众推吴亚忠为首，小张三为副，继续坚持反清斗争。
1863年8月8日，袁甲三病重，魏宣武前往探视，袁甲三咳了半晌才断断续续说：“锐王，我有一事对不住你，当年黑衣人行刺是我安排的，这么多年了，此事一直藏在我心中，我有愧啊。”魏宣武道：“其实探子营都探明告诉我了，彼时各为其主，老先生不必挂怀。”袁甲三又道：“我走之后，还请锐王善待我的家人。”“魏宣武道：“老先生只管放心，小午兄乃人中俊杰，国之柱石，正要倚重的。”袁甲三闻言感佩拜谢。当夜，袁甲三卒。魏宣武厚葬袁甲三，以其子袁保恒为锐王府兵务司总司。
在开封的魏宣武接到苗沛霖战死的消息，看着他《秋霄独坐》中写的：“杜鹃啼血霜华白，魑魅窥人灯火青；我自横刀向天笑，此生休再误穷经。”不禁感叹，此人志大才疏，反复无常，如此谢幕也算是最好结局了。又对谭绍光的死无比惋惜，对郜永宽等八人无比愤恨，对李鸿章杀降的行为嗤之以鼻。魏宣武见各路英雄死的死，走的走，纷纷落幕，李秀成二十万大军奈何不了曾国荃二万湘军，就知道洪秀全已是强弩之末，接下来将要独自面对清军了。魏宣武知道，面对即将到来的狂风暴雨，唯有大力发展经济军工，训练军队，增强实力才能自保并争天下。1863年3月，魏宣武仿湘军建立抚恤制度，对死、伤、残士兵厚加抚恤。
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