秦穆公三十四年（前626年）或三十五年（前625年）春季，秦穆公派孟明视等率兵攻打晋国，以报崤之战之仇，晋襄公领兵抵抗。二月七日，两军在彭衙（今陕西白水东北）交战。秦军大败，孟明视等退兵返回国。晋国人把秦军称为“前来拜谢恩德的部队。”但秦穆公还是任用了孟明视，孟明视更加努力于修明政事，给百姓以更大的好处。冬季，晋国的先且居、宋国的公子成、陈国的辕选、郑国的公子归生攻打秦国，夺取了汪地（今陕西澄城西），到达彭衙后撤军，报了彭衙之战的仇。
秦穆公三十六年（前624年），秦穆公再次重用孟明视等人，派他们领兵攻打晋国。秦军渡过黄河后就焚烧渡船，把晋军打得大败，攻取了王官（今山西闻喜南）和鄗地（今山西闻喜西），报了崤之战的仇。晋国人都守着城池，不敢出战。于是，秦穆公从茅津渡过黄河，筑坟埋葬从前在崤山战死的秦军士兵，为他们追悼发丧，痛哭了三天。秦穆公面对全军发誓说：“将士们！听着，不要喧哗，我向你们发誓。古代的人向老年人请教，就没有办错的事。为了反思我不采纳蹇叔、百里奚的劝谏而犯下的过错，所以作了这篇誓词，让后代记住我的过失。”
秦穆公三十四年（前626年），戎王听说穆公贤明，派由余到秦国考察。秦穆公向他展示秦国的宫室和积蓄的财富，对由余看后的回答感到惊讶，便向他询问治理国家的方法，得到回答后发现由余贤能，于是采用内史廖的建议，最终让由余离开戎王而归降秦国。秦穆公用接待客人的礼节接待他，询问攻打戎族的方式。
秦穆公三十七年（前623年），秦穆公采用由余的计谋攻打戎王，生擒了戎王，使十二个戎国服于秦国，秦国疆域增加了周边千里的土地，称霸西戎。周襄王派召公过带着金鼓等贺礼向秦穆公祝贺。 [1-3] [63-65]秋季，晋襄公攻打秦国，包围了邧地、新城，报了王官之战的仇。楚国人灭了江国（今河南正阳西南），秦穆公身着素服，移居侧室，减少膳食，撤除音乐，以表示哀悼，礼数超过了规定的限度。大夫劝谏他，他说：“同盟国家被灭亡，即使未能援救，难道还能不哀悼吗？我是以此来警戒自己啊。”
秦穆公三十九年（前621年），秦穆公去世，安葬于雍邑（今陕西凤翔东南），陪葬的有一百七十七人，秦国的良臣子舆奄息、子舆仲行、子舆针虎也在陪葬者之列。秦国人哀悼他们，为他们作了《黄鸟》一诗。
秦国地处陇西，虽然文化相对于中原地区落后，但秦穆公用人不以宗亲、等级划分、地域 、国家为标准，唯以贤能为依据，四处搜罗异国的贤能之士，不仅选用宗族姻亲和秦国士大夫，也开始任用外来的人才，委以重任，用人不疑，充分发挥贤能之士的能动性，为国家的政治改革、军事行动积极地出谋划策。 [4] [71]先以秦穆公五年（前655年）用五张黑公羊皮从楚国人手中赎回百里奚，并在百里奚的推荐下从宋国迎来蹇叔；继以秦穆公十年（前650年）接纳自晋国逃到秦国的丕豹；后以秦穆公三十四年（前626年）通过内史廖的谋略而从西戎得到由余。
在诸多贤能之士的帮助下，秦穆公曾三次置立晋君，多次平定晋乱，取得了河西之地，使十二个戎国服于秦国，扩大了秦国东、西方疆域，称霸西戎，且霸主地位得到周天子的认可，提高了秦国的地位。
此外，以贤能为用人依据，冲淡了宗法因素在秦国选官制度上的影响，开秦国任用客卿制度之先河，为之后秦国以及秦朝任用异国能人为高官提供了范例。如秦孝公任用商鞅变法，秦惠王用张仪，秦始皇用李斯。秦国以开放的态度，包容了各国的各类人才，为秦国的强大以及统一六国奠定了人才基础。
由于秦穆公具有远见卓识，能够敏锐地观察到民心向背对于国家政治发展的重要性，并且汇集在其身边的百里奚 、蹇叔、公孙支等人皆是从中原地区而来，受到中原地区的民本思想的影响很大，他们在秦穆公进行国家决策之时，会从顺应民意的立场出发，能够给予秦穆公民本思想方面的建议。因此，秦穆公注重秦国内外的民心，增强国民凝聚力，提高国家威望。
一方面，对于吃掉自己好马的三百多个乡里人，秦穆公以“君子不以畜产害人”，并没有处罚他们，而是赦免了他们的罪责，同时赐酒给他们喝，取得民心，结果在韩原之战时得到他们的回报，反败为胜。
另一方面，在秦穆公十三年（前648年）晋国发生饥荒而民不聊生时，秦穆公没有听从丕豹趁晋国发生饥荒而借机攻打晋国的建议，而是听从和采纳了公孙支和百里奚的意见，重视民生，顺从晋国的民意，决定伸出援手，救助晋国的百姓，派人将秦国的粮食分水路和陆路，浩浩荡荡地从秦国的雍地运送到晋国的绛地，成就“泛舟之役”，赢得了民心，提高了秦穆公在中原各国中的声望。
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