与荷兰人一战如此轻易获胜是沈磊怎么也想不到的，而且这一胜为他下面的计划打开了大门。但他也没有太留恋胜利者的荣耀，甚至是次日的受降也没有留下来参与。将后续处理事项包括俘虏政策等一一安排妥当，他这一日上午就乘坐了一艘探海回了基隆。
回家时青萍虽从沈磊之前派出哨海向淡水与基隆通报胜利消息时已经知道，但见到他时仍然激动不已。匆匆赶回来沈磊当然不是儿女情长，主要是战场已经不必他再亲自决断。
后面的事下面的人完成没什么难度，主要是将俘虏集中缴械、登记。甄别之类，包括伤员处理、缴获物资与人员等运回才能下一步安排。
如对真查出俘虏中有残杀平民行为也会处理，其他如铁、木之类工匠会安排他们干比较专业的活，并安排一些工人学习他们的技艺，与中国这里的技艺进行比较与借鉴。另外医学或有其它科学技术者也安排相关工作，与中国同行进行一些交流活动，如此可以提高他手下的技能。
另外所有俘虏肯定要干活，任务是从台北往台南修建沿海岸干线。对俘虏大致上就如此安排，而给巴达维亚送信不急，只需让商船南下时在澳门找人带去就行。
俘虏处理不急，因为将俘虏们归拢，包括临时营地的撤退回来等需要不短时间。接下来还有各方面总结与庆功表彰等事要办，整个过程费时不会短的。
而他马上要处理的乃是对台南的占领，实际上此时台湾也是对外有些交往的，而交往的地点基本上在台南。交往的内容主要是福建商人、日本商人、荷兰人等进行商品交换与买卖。荷兰人之所以占领澎湖也是为了更方便交易而已，他们是想将这里当作越过马尼拉，建立对华、对日大商港。
但荷兰人对这里的区位优势有点儿想当然，最终并未达到取代马尼拉的地位，最后还让郑成功赶走了。而沈磊虽不大清楚历史细节，但他大概知道一点，所以先让探海一号实际探查淡水与基隆，移民后又派人调查台南，对自己这里外又千方百计掩饰。
正因为如此外人对沈磊这里所知甚少，基本上都当作一个大财主在屯垦，人虽不少实力不强。这样的影象是这里没有直接向商人出售的产品，也不大让外面商人自由活动。这一来少有商人进入淡水与基隆，因为进来者也无利可图不再复来。
反之台南的情形沈磊是完全清楚的，当地的私港行为对他没什么损失，加上荷兰人这个大敌未去他只恐爪牙藏之不深，所有的战船训练、捕鲸活动都在北面与东边海面，连护卫队营房也在丘陵地带，只为此时已胜之战不出现任何意外。
如今一战将荷兰人全灭，靖海计划也会大规模展开，不必再隐藏实力对台南的占领也可以马上展开。一来台北这里耕地开发面积已不少，而那里的耕地更多几倍，也应该开发开发了。
另外那里的私港区位优势虽不如马尼拉，开发出来成为自己今后一段时间的转口贸易据点也是可行与有利可图的。为此沈磊在澎湖一战取得完全胜利后，马上回基隆开始筹划此事。虽然对此之前有过预案，但想不到此战如此顺利，具体行动计划还需要他细致考虑与安排。
在台南建立一个贸易中心已经定局，具体地点他还没有决定。主要是荷兰人建立的热遮兰城所在地的港口不大。他的心中将高雄港即此时称之为打狗港作为选址，就是此时台南私港众多，那里现在土着、日本人、海盗、及私商交集，他对行动手段强度还要斟酌一下再下手。
在此情形下当然手段可以强硬一些，所以他决定先作好规划，等作战部队回来作好战斗总结、表彰后，一下派出一个营及几条武装探海，彻底镇住场子，将一切控制起来才行。这就是要么不出手，一出手就不让这事有反复。而且在那里垦荒，建商业，统一管理也是要同步进行。
占领台南没什么阻力，不必从长计议但也需要集结好人员，准备好物资一举成功，因而此时尚先规划细节暂定下半年行动。
另有一个消息也得沈磊先回去处理，那就是闻香教的徐鸿儒五月十一日在郓城造反，即时攻占了郓城，此时发展到什么规模他即便是有哨海送达情报也没有实时的传递速度。
首先徐鸿儒起义在郓城，他的情报网不可能遍布每个县，暂时也不必要有时效性极强的情报。所以此时他获得山东的情报以十天前发生的算是当时的，路远一点一个月也算是及时的，此时知道这件事还不晚，后续情报只能等以后送来。
对徐鸿儒造反目的沈磊也不是太关注，大致了解他乃是属白莲教系统，虽然也是有明末激烈冲突的社会矛盾因素，但主要是白莲教属于造反专业户，在将他当作纯农民起义有点拔高与言过其实。
而且是徐鸿儒一起事就自称中兴福烈帝，封亲王、封丞相、封总兵、架子完全搭起，草台班子也是好位子占尽，真发展下去也只能如太平天国一样大肆封王了。
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