李斯认为：由于时代的变化，五帝三代的治国办法也不同。三代时期的做法，也并不值得效仿。那时候诸侯并列，互相争夺，天下统一，情况完全不同，不必效仿古代。以古非今，搅乱民心。对于造谣惑众，不利于统一天下的言行必须禁止，否则将会影响政局的稳定，有损于皇帝的权威。最后，他又把这一切都归罪为读书的缘故，建议秦始皇下令焚书。
凡是秦记以外的史书，不是博士（指掌管古今文史典籍的官）所藏的诗、书、百家语都要烧掉，只准留下医药、卜筮、种树之书。 秦始皇下令焚书，先秦许多文献古籍都被烧掉了，使中国文化遭到了巨大的损失。然而，另一方面秦始皇也曾将一些禁书收藏在咸阳皇家图书馆，使得部分珍贵书籍得以保存了下来。只是后来项羽攻破秦宫，焚毁秦宫，所珍之书物，皆没也，此为后来之事情。
李斯在秦始皇死后，勾结赵高辅助胡亥上位为秦二世，间接害死扶苏和蒙恬以及秦始皇之子女，自己落得如此下场也是罪有应得。
丞相李斯死后，赵高为了达到自己彻底专权的目的，对胡亥说了一大通很有“道理”的话，大意就是说胡亥年轻，经验不足，而且皇帝也应该少和大臣们见面，以免在大臣们面前暴露自己的弱点。 如果能居住深宫中听取赵高他们的汇报，有他们这些“栋梁之才”来辅佐，那国家会治理得更好。
秦二世胡亥一听有道理，而且他也愿意呆在后宫中享乐，从此，朝中大小政事都由赵高一人来独断专行，并且升赵高为丞相。
丞相赵高虽然大权在握，但他也害怕大臣们联合起来反对他，为了试验大臣对他的真实态度，赵高精心策划了一起在此后历史上遗臭万年的政治事件：指鹿为马。
在一次朝会上，赵高弄来一只鹿作为礼物献给胡亥，对秦二世胡亥说这是一匹好马。秦二世胡亥听了不禁笑出了声，说道：“丞相怎么开这样的玩笑，这明明是只鹿，你怎么说是马呢？”
丞相赵高仍然坚持说眼前的鹿就是是马，秦二世胡亥便问在场的大臣们。大臣们因为害怕赵高的权势，又不知道赵高葫芦里卖的什么药，于是就有很多人随声附和着说是马。 而其他的人有的说是鹿，而有的臣子则是装聋作哑。事后，赵高便根据大臣们的不同说法区别对待：说是鹿的人一律找借口杀死，说马的人则被当成自己一派的人。
秦始皇虽然统一六国、统一文字以及度量衡，是结束了春秋战国百来年之乱，但是秦始皇嬴政之恶甚于夏桀商纣。夏桀商纣虽然残暴，但是危害只是自身江山而已，秦始皇则是自起坟墓，为避天降陨石之示警滥杀附近百姓，为平人之议论焚书坑儒。虽然后世之人研究多是说坑术士，却难避管辖之下有冤杀之无辜儒生，何况古来术士之说非单单指的是炼丹之术士，术士所指乃是学术之术，凡专研做学问之人，皆可称呼为术士。此行为更加显示了秦始皇帝嬴政之恶，屠杀做学问之人，并焚毁书籍，断灭了华夏之多少原本珍贵学问之书籍。秦始皇嬴政死了之后，又殃及无辜，虽妃嫔殉葬出自胡亥之口，不在秦始皇嬴政之过。但是工匠掩死陵墓之中，实际就是秦始皇嬴政所开之先列。复又宠信赵高这样的小人，使此等小人危害自己的秦朝江山，令其自己后代死于自己小儿子胡亥之手。
正是：
秦始皇作恶子恶，因教骨肉相残伐。
祖龙之法未轻变，却使严法更狠毒。
欲知秦二世胡亥后来之事，且看下章回之分解。
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