《牛津古希腊与罗马百科全书》（The Oxford Encyclopedia of Ancient Greece and Rome）谨慎指出，尼禄在公元59年杀害其母的原因“尚未完全清楚”。
根据塔西佗（Tacitus）的记载，尼禄与母亲之间的冲突源于他与波佩娅·萨宾娜（Poppaea Sabina）的婚外情。
在《历史》（Histories）中，塔西佗写道，这段关系始于波佩娅仍嫁给鲁弗里乌斯·克里斯皮努斯（Rufrius Crispinus）时，但在他后来的作品《编年史》（Annals）中，他指出这段关系始于波佩娅嫁给奥托（Otho）时。
在《编年史》中，塔西佗提到阿格里庇娜反对尼禄与波佩娅的关系，因为她对尼禄的妻子奥克塔维娅（Octavia）怀有深厚感情。
安东尼·A·巴雷特（Anthony A.Barrett）写道，《编年史》中塔西佗的叙述“表明波佩娅的挑战将尼禄推向崩溃”。
一些现代历史学家指出，阿格里庇娜之死对波佩娅几乎没有任何好处，因为尼禄直到公元62年才与波佩娅结婚。
巴雷特写道，波佩娅似乎是塔西佗用作“文学手法的一种工具，因为塔西佗无法找到尼禄行为的合理解释，同时也用来表明尼禄与克劳狄乌斯（Claudius）一样，受到了一个女人的恶劣影响”。
现代学者认为，在阿格里庇娜去世前的几年中，尼禄的统治表现良好。
例如，尼禄推动了尼罗河（Nile）源头探索的成功远征。
在阿格里庇娜被流放后，布鲁鲁斯（Burrus）和塞涅卡（Seneca）负责管理帝国事务。
然而，在其母去世后，尼禄的“行为变得更加恶劣”。
米里亚姆·T·格里芬（Miriam T.Griffins）提出，尼禄的堕落可能早在公元55年谋杀其同母异父兄弟布里塔尼库斯（Britannicus）时就已开始，但她也指出，“尼禄在母亲去世后完全丧失了是非观念，并对奉承言辞深信不疑”。
格里芬提到塔西佗“明确指出了阿格里庇娜被除去对尼禄行为的重大意义”。
他从大约公元60年开始建造一座新宫殿——过渡宫（Domus Transitoria）。
该宫殿旨在将通过各种方式获得的所有帝国庄园与帕拉蒂尼山（Palatine）连接起来，包括迈塞纳斯花园（Gardens of Maecenas）、拉米亚花园（Horti Lamiani）、洛利亚尼花园（Horti Lolliani）等。
公元62年，尼禄的顾问布鲁鲁斯去世。
同年，尼禄发起了他统治期间的第一次叛国审判（maiestas trial），对象是安提斯提乌斯·索西亚努斯（Antistius Sosianus）。
他还处决了其政敌科尔内利乌斯·苏拉（Cornelius Sulla）和鲁贝利乌斯·普劳图斯（Rubellius Plautus）。
于尔根·马利茨（Jürgen Malitz）认为这是尼禄与罗马元老院（Senate）关系的一个转折点。
马利茨写道，“尼禄放弃了此前表现出的克制，因为他认为支持元老院的路线越来越无利可图”。
在布鲁鲁斯去世后，尼禄任命了两位新的禁卫军长官（Praetorian prefect）：费尼乌斯·鲁弗斯（Faenius Rufus）和奥福尼乌斯·提盖利努斯（Ofonius Tigellinus）。
政治上孤立的塞涅卡被迫退休。
根据塔西佗的记载，尼禄以不育为由与奥克塔维娅离婚，并将其流放。
在公众因奥克塔维娅被流放而抗议后，尼禄指控她与阿尼切图斯通奸，并将其处决。
在公元64年的萨图尔纳利亚节（Saturnalia）期间，尼禄与一位自由人皮塔哥拉斯（Pythagoras）结婚。
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