栾廷玉并非等闲之辈，他将秦明引至荒草地，利用地形优势设下了埋伏。秦明在酣战之中，不料战马被绊倒，自己也随之身陷祝家庄的重围之中。幸运的是，后来梁山军队攻陷了祝家庄，秦明才得以获救。
此后，宋江兵发高唐州，秦明再次作为前路先锋，与林冲、花荣等人并肩作战。面对高廉的妖法，众将一时不敌，秦明和吴用等人巧妙配合，夜间在土坡上埋伏高廉。当高廉来劫营时，秦明等人齐心协力，射伤了高廉，迫使其退兵。不久后，公孙胜回梁山协助破城，众人得胜回山。
在呼延灼率师攻梁山时，宋江再次调兵遣将。秦明率先带领军队下山，在平原旷野处布阵迎敌。天亮，他纵马执狼牙棍与韩滔交手二十余合，韩滔败相已现。次日，秦明站在五队先锋的中心位置时，呼延灼发动了连环马阵，导致黄信中箭受伤。这一变故让秦明痛心疾首。
徐宁归顺梁山后，秦明与花荣、孙立等人率领军队在山脚叫阵，成功击溃了呼延灼的连环马阵。秦明开路作先锋攻打青州。手执狼牙棍厉声高骂，迎战呼延灼。两人斗到四五十合依然不分胜败。秦明又与孙立、花荣等人扮作军士潜入城中将慕容知府一棍打死继而攻破青州。
之后宋江又发起了对华州的攻击。秦明与花荣等人并作先锋至少华山与宋江等人汇合并乘着夜色抵达华州城下待命。第二晚秦明等人在渭河渡口岸上埋伏了一夜准备给敌人一个措手不及的打击。秦明与花荣陪同宿元景上少华山与呼延一同率领军队取华州城再次取得了胜利。
晁盖不幸身亡后，宋江开始暂居梁山泊主之位，秦明则在忠义堂中位列第五。在宋江攻打大名府的战役中，秦明担任前军头领，率先与闻达、索超展开激烈对决。秦明与索超交战二十余合，双方势均力敌，难分胜负。就在此时，韩韬以弓箭精准射中索超左臂，索超无奈丢弃大斧，仓皇逃跑。
此役过后，秦明率军突破庾家墥，杀入飞虎峪，在关胜攻打梁山时，秦明与林冲并肩作战，共同对阵关胜。正当二人即将取得胜利之际，宋江出于爱才之心，想要收关胜为山寨头领，担心关胜阵亡，便鸣金叫二人退下。随后，秦明又与孙立一同击败了宣赞，为梁山再添胜绩。
在吴用策划攻打大名府时，秦明与欧鹏、邓飞、杨志组成第四队，杀入大名府，在宋江决定分五路进攻曾头市时，秦明与花荣、马麟、邓飞负责攻打南大寨。由于李逵中箭，他们不得不撤军。次日，秦明与史文恭对阵，不幸中枪受伤，只得回山养伤。直到大聚义前，秦明都在养伤之中。
梁山排座次时，秦明因其贡献卓越，排名第七，被封为“天猛星霹雳火秦明”，位列马军五虎将之三，与索超、欧鹏、邓飞一起镇守梁山正南旱寨。朝廷派遣陈宗善到梁山招安时，五虎将本有意杀掉李虞侯、张干办，最终未遂。随后，朝廷派遣童贯攻梁山，吴用布下四斗五方旗，秦明率正南红旗军出战，击杀陈翥，并与董平、索超杀入童贯阵中，众人回山献功。不久后，朝廷再次派遣高俅率十节度攻打梁山，秦明、关胜、呼延灼、张清四人活捉了韩存保。次日，秦明等人在柳树阴率红甲军冲出，杀死刘梦龙的大半军队，最后打败高俅，梁山众人接受招安。
招安后，秦明参与了征辽、征田虎、征王庆的全过程以及征方腊的前大半段战役。在征辽过程中，秦明与林冲、花荣、索超一同生擒了被张清用飞石打下马的阿里奇；征田虎时，他的狼牙棒被公孙胜施法与乔道清用法术操纵的钢枪在空中对战；征王庆时，他与“纪山五虎”之一的袁朗大战一百五十余合；征方腊时，他有杀对方将领凤仪等战绩。
在征讨方腊的过程中，秦明于青溪县界迎战方腊的皇侄方杰。二人酣战三十余合后，南军将领杜微见方杰不能取胜，从方杰背后闪出用飞刀砍向秦明。秦明因躲闪飞刀注意力分散被方杰趁机一戟刺死。
后来，宋江回京上表秦明皇上后，被追封忠武郎
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