在宇宙的犄角旮旯里，熵变原界可是个藏着神秘熵变灵素的好地方。这些小粒子们就像一群调皮的孩子，一会儿无序地涌动，一会儿又撞来撞去，还时不时地融合和分裂一下。它们可有本事了，能把秩序给瓦解了，再重新塑造一个新的。这地方的空间就跟折纸一样，一会儿折起来，一会儿又塌下去，时间也变得乱七八糟，一会儿倒流，一会儿加速，一会儿又停滞不前。而且啊，它还被熵锁结界给围得严严实实的，一直都没人发现呢。
有一支专门探索宇宙里那些不为人知的能量的科研小队，他们可厉害了，率先发现了这里的异常。他们的飞船上装了个熵变感应仪，一靠近熵变原界就开始“滴滴滴”地报警。这可把大家吓了一跳，一看，原来是熵锁结界在发抖，还不停地往外释放熵爆冲击呢。这冲击就像一阵超级高速的旋风，到处乱跑，把物质的分子结构都给打乱了，结果星球上的东西都消散了，又重新组合起来，生态也被破坏得一塌糊涂。星际的能量通道也变得弯弯曲曲的，好多文明的能源都枯竭了。
蓝星的宇宙熵能研究中心收到了这个信号，马上就判断出这是关系到宇宙生死存亡的大危机啊。经验丰富的九儿和一个年轻的小伙子被派去调查。小伙子看着监测数据，兴奋得不行，又有点紧张：“妈妈，这次的异动说不定能让我们重新认识宇宙的本质呢，这可是个大机遇啊，不过也是个大挑战。”九儿的脸色可严肃了，她点点头说：“影响太大了，宇宙的秩序现在很危险，我们一定要全力以赴啊。”
蓝星的科研团队那可是加班加点，没日没夜地干活，终于改装出了一艘熵变探索者号飞船。这飞船可厉害了，装了熵能调和引擎和超维导航系统。前者可以调节飞船的能量，让它和熵变原界达到熵平衡，这样就不会受到干扰啦；后者是基于量子和多维定位技术的，能保证航行的安全。等靠近熵变原界的时候，空间变得扭曲起来，光线也变得奇奇怪怪的，仪器又开始报警了。小伙子赶紧操控飞船，用熵变频谱分析仪监测熵爆冲击。
历经艰难，他们进入核心区域，看到一座悬浮在熵变灵素风暴中的熵变圣坛。圣坛由未知晶体构成，符文流动，周围熵变光环旋转，散发紊乱波动。圣坛发出精神波动：“我承载宇宙初始熵变法则，现被熵寂深渊的吞噬者觊觎，他们想打破平衡，带来混乱死寂。”九儿回应：“我们来阻止邪恶，请问如何帮忙？”
圣坛表示要集齐星辰熵变之镰、命运熵变残页和熵变平衡宝玉。星辰熵变之镰能净化熵变灵素、唤醒守护意志；命运熵变残页可助在混乱命运轨迹中找关键节点；熵变平衡宝玉掌控熵变能量平衡法则，是恢复秩序的关键。
九儿和青年即刻出发。在星熵幻域，他们被强大熵变之力笼罩，一番搜寻后在星辰碎片祭坛找到星辰熵变之镰，用熵能共振装置解除护盾拿到。
命运熵变残页在命运熵变迷沼，此地命运熵变丝线交织，遍布吞噬一切的漩涡。他们多次遇险，最终在最深处找到残页。
熵变平衡宝玉在熵变失衡炼狱，这里熵变能量失衡引发风暴。他们与守护者沟通后，用熵能调和装置调整能量，恢复平衡，拿到宝玉。
带着三件圣物回到熵变圣坛，圣坛吸收后力量觉醒。熵变吞噬者派出熵变暗影生物抢夺，这些生物有的像黑色熵变晶体，能瞬间熵化物体，有的像暗影火焰，污染熵变灵素。
九儿和青年与熵变圣坛并肩战斗。青年操控飞船用熵变脉冲炮攻击，熵变暗影生物借混乱空间和无序熵变之力躲避。九儿持星辰熵变之镰念咒，释放净化之光，让熵变暗影生物行动迟缓。熵变圣坛释放护盾并发射震荡波，与敌人碰撞引发爆炸。
战斗白热化时，青年发现熵变暗影统领，驾驶飞船发射熵变导弹，被其熵变混沌屏障挡住。九儿借助熵变圣坛之力，用星辰熵变之镰发出净化光柱打破屏障。青年抓住机会，发射熵变毁灭光束，贯穿统领核心将其消灭。
其他熵变暗影生物大乱，九儿和青年乘胜追击，成功守护熵变圣坛。圣坛称赞他们拯救了宇宙熵秩序，鼓励他们继续探索。
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