公元600年春季，二月，熙州人李英林发动叛乱。三月，辛卯日，朝廷任命扬州总管司马、河内人张衡为行军总管，率领五万步兵和骑兵讨伐并平定了叛乱。
贺若弼又因获罪被关进监狱，隋文帝列举他的罪状说：“你有三个‘太过分’：嫉妒心太过分，自以为是、颠倒是非的心太过分，目无君主的心太过分。”不久后又释放了他。后来有一天，隋文帝对侍臣说：“贺若弼在即将讨伐陈朝时，对高颎说：‘陈叔宝一定能被平定。难道会出现飞鸟打尽、良弓收藏的结局吗？’高颎说‘绝对不会这样。’等到平定陈朝后，贺若弼立刻索要内史的官职，之后又索要仆射之位。我对高颎说：‘功臣本该授予勋官，不能参与朝政。’贺若弼后来又对高颎说：‘皇太子对我，无话不谈、毫无保留。你终究会依靠我的力量，何必这样沉默不语呢！’他图谋广陵，又图谋荆州，这两处都是容易发生叛乱的地方，他的野心始终没有改变。”
夏季，四月壬戌日，突厥达头可汗侵犯边境，隋文帝下诏命令晋王杨广、杨素从灵武道出兵，汉王杨谅、史万岁从马邑道出兵，攻打突厥。
长孙晟率领归降的突厥人担任秦州行军总管，接受晋王杨广的指挥。长孙晟知道突厥人饮用泉水，容易下毒，于是就搜集各种毒药投放到泉水上游，突厥的人畜饮用后大多死亡，突厥人大惊失色说：“上天降下恶水，是要灭亡我们吗！”于是连夜逃走。长孙晟率军追击，斩杀一千多人。
史万岁出塞后，抵达大斤山，与突厥军队相遇。达头可汗派使者询问：“隋朝的将领是谁？”侦察骑兵回复：“是史万岁。”突厥使者又问：“难道是当年那个敦煌戍卒吗？”侦察骑兵说：“正是他。”达头可汗害怕，于是率军撤退。史万岁驰马追击一百多里，发兵猛攻，大败突厥军队，斩杀几千人；又乘胜追击，深入沙漠几百里，直到突厥人远远逃走才率军返回。隋文帝下诏派长孙晟再次返回大利城，安抚新归附的突厥人。
达头可汗又派他的侄子俟利伐从沙漠东面攻打启民可汗，隋文帝再次出兵帮助启民可汗防守战略要地；俟利伐战败后逃回沙漠。启民可汗上奏表谢恩说：“大隋圣人可汗怜悯养育百姓，如同上天无所不覆盖，大地无所不承载。我染干就像枯木重新长叶，枯骨重新长肉，千秋万代，永远为大隋掌管牛羊马匹。”隋文帝又派赵仲卿为启民可汗修筑金河、定襄两座城池。
秦孝王杨俊长期患病，无法起身，派人上奏表谢恩。隋文帝对他的使者说：“我竭尽全力创下这份大业，制定家训、树立榜样，希望臣子们遵守。你是我的儿子，却想败坏这份家业，我不知道该如何责罚你！”杨俊又惭愧又恐惧，病情也愈发严重了，隋文帝于是再次授予他上柱国的官职；六月丁丑日，杨俊去世。隋文帝为他哭了几声就停了下来。杨俊生前建造的奢侈华丽的物品，隋文帝下令全部烧毁。王府的官员请求为他立碑，隋文帝说：“想要留名，一卷史书就足够了，何必用石碑呢！如果子孙不能保住家业，石碑不过是给别人当垫脚石罢了！”杨俊的儿子杨浩，是崔妃所生；庶子名叫杨湛。群臣迎合隋文帝的心意，上奏说：“汉朝栗姬的儿子刘荣、郭皇后的儿子刘强，都随着母亲被废黜而失去继承权，如今秦王的两个儿子，母亲都有罪过，不应该继承爵位。”隋文帝采纳了他们的建议，让秦国的官员担任丧主。
起初，隋文帝让太子杨勇参与决断军国政事，杨勇有时会提出修改意见，隋文帝都会采纳。杨勇性格宽厚，行事随心所欲，没有虚伪掩饰的行为。隋文帝生性节俭，杨勇曾经对蜀地出产的铠甲进行纹饰美化，隋文帝看到后很不高兴，告诫他说：“自古以来，没有哪个帝王喜好奢侈而能长久统治的。你作为皇位继承人，应当把节俭放在首位，才能供奉宗庙。我过去的衣服，各留下一件，时常拿出来看看，以此警戒自己。我担心你因为现在皇太子的身份而忘记过去的事情，所以赐给你我过去佩戴的一把刀，还有一盒酱菜，这是你当年做上士时经常吃的东西。如果能记住过去的事，就应该明白我的心意。”
后来到了冬至，文武百官都前往东宫朝见杨勇，杨勇设置音乐接受朝贺。隋文帝知道后，问朝中大臣：“最近听说冬至那天，朝廷内外的百官一起去东宫朝见，这是什么礼仪？”太常少卿辛亶回答说：“到东宫，是祝贺，不能说是朝见。”隋文帝说：“祝贺的人按理说不过几十人，各自随意来去，怎么会由有关部门征召，一时之间全部聚集！太子穿着礼服、设置音乐来接待他们，合适吗？”于是下诏说：“礼仪有等级差别，君臣不能混淆。皇太子虽然是皇位继承人，兼具臣子的身份，但各地的州牧、郡守在冬至这天朝贺，进献地方特产，却另外向皇太子上贡；这种做法不符合典章制度，应当全部停止！”从此，隋文帝对杨勇的恩宠开始衰减，逐渐产生猜疑和隔阂。
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