消毒水的气味在病房里弥漫，明羽在混沌中挣扎着睁开眼睛。眼前是一片模糊的光晕，尖锐的啼哭声响彻耳畔，那声音里带着新生儿特有的脆弱与不甘。
是个男孩，7斤2两，很健康。护士温柔的声音传来，明羽这才惊觉，自己竟成了襁褓中的婴儿。
他最后的记忆还停留在电脑前敲击键盘的瞬间——那时他还是一名宝可梦同人小说家，正在构思新的故事，可此刻，现实却远比他笔下的任何情节都要荒诞。
明羽努力转动着沉重的脑袋，目光扫过病房。真新镇医院特有的装潢风格映入眼帘，淡黄色的墙壁，木质的家具，一切都和记忆中的动漫场景一模一样。窗外透进的阳光洒在白色的被褥上，形成一片片斑驳的光影。
隔壁传来另一声啼哭，紧接着是医生欣喜的声音：大木博士，恭喜啊，您的孙子平安出生了！听到这话，明羽心中猛地一颤，这不就是小茂出生的场景吗？
他试着动了动手指，却发现根本无法控制自己的身体。婴儿的四肢软弱无力，连简单的动作都难以完成。但他的意识却异常清醒，清楚地知道自己已经穿越到了宝可梦的世界，而且，还和小智、小茂同一天出生。
就在这时，走廊里传来一阵急促的脚步声，紧接着是一个女人惊喜的声音：太好了，是个男孩！以后他和小智一定能成为好朋友！小智这个名字，明羽的心再次揪紧。原来，他真的来到了宝可梦的世界，而且，命运从一开始就将他和这两个主角联系在了一起。
但很快，一个更令人震惊的想法涌上明羽心头。如果这是宝可梦的世界，那么，赤红和青绿是否也存在？在宝可梦的游戏设定中，赤红和青绿是与小智、小茂对应的角色。如果这个世界同时存在他们四人，那么，这个世界远比他想象的要复杂得多。
明羽努力回想自己看过的所有宝可梦资料，试图理清头绪。动漫、游戏、漫画，不同的作品中有着不同的设定和故事线。而现在，他似乎来到了一个将所有设定融合在一起的世界。这里既有动漫中的温馨日常，又有游戏里的激烈对战，还有漫画中隐藏的黑暗面。
孩子的名字想好了吗？护士的声音打断了明羽的思绪。
就叫他明羽吧，希望他能像羽毛一样，自由地追逐自己的梦想。母亲温柔的声音带着满满的爱意。就这样，明羽在这个充满未知的世界里，拥有了自己的新身份。
时光在婴儿的啼哭与奶香中悄然流逝。随着身体的逐渐成长，明羽开始能够看清周围的世界。真新镇是一个宁静而美丽的小镇，蓝天白云下，成片的草地和森林延伸到远方。镇中心的宝可梦研究所总是人来人往，大木博士忙碌的身影时常出现在门口。
在父母的悉心照料下，明羽慢慢学会了走路和说话。每当夜幕降临，母亲总会抱着他坐在窗前，给他讲述宝可梦的故事。那些在他前世早已烂熟于心的传说，如今从母亲口中娓娓道来，却有着截然不同的感受。
一天，明羽在院子里玩耍时，偶然听到了父母的谈话。
听说大木博士最近在研究一种新的宝可梦进化理论，好像和mega进化有关。父亲的声音中带着一丝担忧，真不知道这种研究会不会带来什么危险。
别瞎想了，大木博士是个很谨慎的人。母亲安慰道，而且，有那么多优秀的训练家在，就算真的出现什么问题，也一定能解决的。
听到mega进化这个词，明羽心头一震。在他前世的记忆中，mega进化是后来才出现的概念，没想到在这个世界，这么早就开始研究了。这更加证实了他的猜测，这个世界的时间线和他熟悉的宝可梦世界并不完全一样。
随着年龄的增长，明羽开始展现出与同龄人不同的特质。别的孩子还在牙牙学语时，他已经能够清晰地表达自己的想法；当其他孩子还在蹒跚学步时，他已经能够稳稳地奔跑。父母对此既惊喜又担忧，他们不知道，自己的孩子体内，住着一个来自异世界的灵魂。
明羽开始利用自己的优势，偷偷收集关于这个世界的信息。他会在父母不注意时，翻看家里的宝可梦图鉴，了解这个世界的宝可梦分布和特性；他会在路过宝可梦研究所时，装作玩耍，偷听里面的研究人员讨论最新的研究成果。
渐渐地，明羽发现这个世界远比他想象的要危险。除了常见的宝可梦对战，还有一些隐藏在暗处的势力，他们在暗中进行着各种非法的宝可梦实验，试图掌控强大的力量。而赤红和青绿，这两个在游戏中创造了传奇的训练家，似乎也在这个世界留下了神秘的足迹。
在明羽三岁那年的夏天，真新镇迎来了一场前所未有的危机。一只失控的暴鲤龙突然出现在小镇附近的河流中，它疯狂地破坏着周围的一切，巨大的身体掀起滔天巨浪，吓得居民们纷纷躲进家中。
大木博士紧急召集了镇上的训练家，试图制服这只暴鲤龙。明羽站在自家的窗前，远远地看着河岸边激烈的战斗。训练家们派出的宝可梦与暴鲤龙展开了殊死搏斗，但暴鲤龙实在太过强大，几轮攻击下来，不少宝可梦都受了重伤。
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