采集诸家本草药品总数
《神农本草经》三百四十七种，并入一十八种：
玉泉（并入玉石部）、丹砂（并入金石部）、空青（并入金石部）、曾青（并入金石部）、白青（并入金石部）、扁青（并入金石部）、石胆（并入金石部）、云母（并入金石部）、朴硝（并入金石部）、硝石（并入金石部）、矾石（并入金石部）、滑石（并入金石部）、紫石英（并入金石部）、白石英（并入金石部）、五色石脂（并入土部）、太一禹余粮（并入土部）、禹余粮（并入土部）
青芝、赤芝、黄芝、白芝、黑芝、紫芝（六芝合并为“芝”类，计入木部）
草部一百六十四种:
菖蒲、菊花、人参、天门冬、甘草、干地黄、术（白术）、菟丝子、牛膝、茺蔚子（益母草）、女萎（玉竹）、防葵、柴胡、麦门冬、独活、车前子、木香、薯蓣（山药）、薏苡仁、泽泻、远志、龙胆、细辛、石斛、巴戟天、白英、白蒿、赤箭（天麻）、庵?子、菥蓂子、蓍实、赤芝、黑芝、青芝、白芝、黄芝、紫芝、卷柏、蓝实、芎?（川芎）、黄连、络石、蒺藜子、黄芪、肉苁蓉、防风、蒲黄、香蒲、续断、漏芦、天名精、决明子、丹参、茜根（茜草）、飞廉、五味子、旋花、兰草、蛇床子、地肤子、景天、茵陈蒿、杜若、沙参、徐长卿、石龙刍、云实、王不留行、牡桂（肉桂）、菌桂、松脂、槐实、枸杞、柏实、茯苓、榆皮、酸枣、干漆、蔓荆实、辛夷、杜仲、桑上寄生、女贞实、蕤核、藕实茎（莲子）、大枣、葡萄、蓬蘽、鸡头实（芡实）、胡麻、麻黄、冬葵子、苋实、白瓜子、苦菜、龙骨、麝香、牛黄、熊脂、白胶（鹿角胶）、阿胶、丹雄鸡、雁肪、石蜜、蜂子、蜜蜡、牡蛎、龟甲、桑螵蛸、海蛤、文蛤、蠡鱼、鲤鱼胆、乌贼鱼骨、白僵蚕、蛇蜕、蜈蚣、蚯蚓、蛴螬、石蚕、雀瓮、樗鸡、斑蝥、蝼蛄、马陆、地胆、萤火、衣鱼、鼠妇、水蛭、木虻、蜚虻、蜚蠊、?虫、贝子、白垩、铅丹、粉锡（铅粉）、代赭、戎盐、卤碱、青琅玕、礜石、石灰、白石英、紫石英、五色石脂、太一余粮、禹余粮、空青、曾青、白青、扁青、石胆、云母、朴硝、硝石、滑石、紫菀、藁本、狗脊、萆薢、白薇
升麻谷部七种：
胡麻（今称芝麻）、麻蕡（大麻的果实）、饴糖（麦芽糖）、大豆黄卷（发芽的大豆）、赤小豆、黍米（黄米）、粟米（小米）
菜部一十三种：
冬葵子、苋实、瓜蒂（或作甜瓜蒂）、白瓜子（即冬瓜子）、苦瓠、水靳（即水芹）、蓼实、葱实、薤（即藠头）、韭、假苏（即荆芥）、苏（即紫苏）、水苏
果部一十一种：
橘柚（橘皮）、大枣、葡萄、蓬蘽（覆盆子类）、鸡头实（芡实）、藕实茎（莲子与莲藕）、杏核仁（杏仁）、桃核仁（桃仁）、梅实（乌梅）、木瓜、柿
木部四十四种：
松脂（松香）、松实（松子）、柏实（柏子仁）、茯苓、榆皮（榆白皮）、酸枣（酸枣仁）、槐实（槐角）、枸杞（枸杞子）、苏合香、橘柚（橘皮，亦列于果部）、蔓荆实（蔓荆子）、辛夷、杜仲、女贞实（女贞子）、桑上寄生（桑寄生）、蕤核（蕤仁）、五加皮、牡荆实（牡荆子）、木兰（厚朴或辛夷类）、桑根白皮、竹叶、吴茱萸、栀子、芜荑、枳实、厚朴、秦皮、秦椒（花椒）、山茱萸、紫葳（凌霄花）、猪苓、白棘（酸枣刺）、龙眼（桂圆）、合欢（合欢皮）、卫矛（鬼箭羽）、紫菀（部分版本归草部）、白杨皮、郁李仁、莽草（有毒，非食用）、雷丸（菌类，归木部）、梓白皮、桐叶（泡桐类）、石南（石楠叶）、黄环（钩吻类，有毒）
土部二种：
伏龙肝（灶心土）、白垩（白善土）
金石部四十一种：
丹砂、云母、玉泉、石钟乳、矾石、消石（硝石）、朴消（朴硝）、滑石、石胆（胆矾）、空青、曾青、禹余粮、太一余粮、白石英、紫石英、五色石脂（赤石脂、黄石脂、白石脂、黑石脂、青石脂）、雄黄、雌黄、石硫黄（硫黄）、水银、石膏、磁石、凝水石（寒水石）、阳起石、理石、长石、铁精、铁落、铅丹、粉锡（胡粉）、代赭（代赭石）、卤咸（卤碱）、白垩、冬灰、青琅玕、礜石、石灰、伏龙肝（灶心土）、铜镜鼻、金屑、银屑
虫部二十九种：
石蜜（蜂蜜）、蜂子（蜜蜂幼虫）、蜜蜡（蜂蜡）、牡蛎（原属介部，部分版本归虫部）、龟甲（原属介部，部分版本归虫部）、桑螵蛸（螳螂卵鞘）、海蛤（原属介部，部分版本归虫部）、文蛤（原属介部，部分版本归虫部）、蠡鱼（鳢鱼，部分归鳞部）、鲤鱼胆、乌贼鱼骨（海螵蛸）、白僵蚕、樗鸡（红娘子）、蚱蝉（蝉蜕）、白颈蚯蚓、蛴螬（金龟子幼虫）、石龙子（蜥蜴）、木虻（虻虫）、蜚虻（牛虻）、蜚蠊（蟑螂）、?虫（地鳖虫）、蛞蝓（鼻涕虫）、蜗牛、水蛭、斑蝥、贝子（贝类，部分归介部）、雀瓮（刺蛾茧）、萤火（萤火虫）、衣鱼（书虫）
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