经过与房、杜二人的谋划之后，李世民终于下定决心，发动玄武门事变，将李建成和李元吉诛杀。事成之后，李世民被立为皇太子，杜如晦被任命为太子左庶子。十月，李世民论功行赏，拜杜如晦为兵部尚书，进封蔡国公，赐实封食邑一千三百户。
贞观二年，李世民命杜如晦以检校侍中之职兼任吏部尚书，仍然总管东宫兵马。杜如晦在任内非常称职。
贞观三年，因发生大旱，李世民让房玄龄、杜如晦、长孙无忌等于名山大川祈雨。同年，杜如晦代替长孙无忌为尚书右仆射，仍旧管理官员的选拔，与房玄龄一起辅佐朝政。建立台阁规模以及表彰人物的事情，都是由房玄龄与杜如晦所定。二人在当时获得的赞誉非常高，称为良相。
贞观四年，杜如晦染病，于是向李世民请求辞官，李世民仍然按照杜如晦以前的官职给他发俸禄，但李世民还是非常担心杜如晦的病情，多次派遣使者和名医前去救治杜如晦，派遣到杜如晦府上的人在路上前后都能望见。但杜如晦最终还是病死，终年四十六岁，李世民为此大哭不止，三天不能处理朝政。转封杜如晦为莱国公。
杜如晦死后，李世民作诏书于着作郎虞世南说：“我和杜如晦之间情义深重，今杜如晦不幸病逝，追念他以前的旧功，我非常伤心，希望你体会到我的意思，为杜如晦制作碑文。”
后来，李世民赏赐给房玄龄一条黄银带，不禁感到伤心，哭着对房玄龄说：“当初你和杜如晦一起辅佐我，但是赏赐只能给你一个人。我听说鬼神什么的害怕黄银，我再拿一条黄金带，你带到杜如晦的灵房去吧。”
贞观五年，李世民因十分想念杜如晦，所以经常梦到他，在杜如晦忌日的那一天，李世民派遣官员到杜如晦家中慰问杜如晦的妻子和孩子，给家里的赏赐还和之前的一样。并且封杜如晦的一个儿子为郡公。
贞观七年，李世民下诏在杜如晦等人的墓前祭少牢。
贞观十七年，李世民命阎立本画长孙无忌、房玄龄、杜如晦等二十四人的画像置于凌烟阁，杜如晦位列第三。
房谋杜断：房玄龄和杜如晦二人同为李世民的宰相，但所起到的作用却是不一样的。房玄龄擅长给李世民出主意，但是同一个问题，他出的主意很多，李世民也不知道采用哪个好，于是这时候杜如晦将房玄龄的主意加以分析，选出一个最适用的办法，让李世民采用。房玄龄帮李世民出主意，杜如晦帮李世民拿定主意，所以称为“房谋杜断”。二人同心同德，相互配合，辅佐李世民处理朝政。时人论及良相时，首推房玄龄与杜如晦。
刀笔之吏：玄武门事变之后，李世民对帐下官属进行论功行赏，文官里，杜如晦与房玄龄功居第一。封赏完毕之后，李世民觉得按照功劳的大小进行封赏，估计不会完全妥当，于是便问诸将谁有意见。淮安王李神通对李世民说：“当初我们举义兵的时候，是我率领兵马先到的。房玄龄、杜如晦不过是刀笔之吏，把他们的功劳放在首位，我不服。”李世民说：“刚刚起兵的时候，人们各怀异心，你虽然率领兵马前来响应，但是不曾上阵杀敌过，在窦建德南侵与征讨刘黑闼的战斗中，你都立有功劳。如今论功行赏，房玄龄与杜如晦有运筹帷幄、安邦定国的功劳，可以比于汉朝的萧何，虽然不是通过上阵杀敌建功立业，但是他们指挥全军获取最终的胜利，所以功居第一。叔父你虽然是皇亲国戚，但在论功行赏上，我不能有所偏颇，滥加赏赐。”李神通是李世民的叔父，俩人关系向来比较亲近，李世民降所有宗室郡王为县公时，只有李神通的爵位保持不变，丘师利等居功自傲的武将们见到李神通都没有得到过多的赏赐，于是都觉得自己没什么好申诉的了。
援救杜淹：李世民攻下洛阳之后，将要处死王世充的部下杜淹。杜淹虽然是杜如晦的叔父，但是向来与杜如晦兄弟不和，而且杜淹还建议王世充杀了杜如晦的兄长，并将杜如晦的弟弟杜楚客囚禁。尽管如此，在要处死杜淹的时候，杜楚客却出来求情，说同族中人相互残杀，太过残忍。于是杜如晦向李世民求情，饶过杜淹。
段志玄，本名段雄，字志玄，淄州邹平县人，祖籍武威郡姑臧县。唐朝名将，并州法曹参军段偃师之子。
身材伟岸，气宇轩昂。随父客居太原，参加晋阳起兵，隶属于秦王李世民部下，擒获名将屈突通，从平洛阳王世充，迁秦王府右二护军，拒绝隐太子李建成的引诱。参加玄武门之变，拥戴秦王李世民即位，拜左骁卫大将军，册封樊国公。出任西海道行军总管，征讨吐谷浑，迁右卫大将军、褒国公、金州刺史，加号镇军大将军。
贞观十六年，病逝，获赠辅国大将军、扬州都督，谥号忠壮，陪葬于昭陵。
段志玄的祖父段瑗，武威人。父亲段偃师，曾任太原郡司法书佐。段志玄身材伟岸，器宇轩昂，但是为人无赖，屡次违反法纪。
六百一十一年，隋炀帝远征高句丽，段志玄时年十四岁，应募从征。后来，段志玄随父亲客居太原，得到李世民的赏识。
六百一十七年，唐高祖李渊在晋阳起兵反隋。段志玄募兵千余人，被授为右领大都督府军头，并担任先锋，夺取霍邑、绛郡，攻打永丰仓，累功至左光禄大夫。
后来，段志玄随刘文静到潼关抵御屈突通。刘文静被桑显和偷袭，军营溃散。段志玄率领二十余骑冲阵，连杀数十人，身中流矢，仍三次冲入敌阵。最终，唐军军心大振，桑显和大败。不久，段志玄与诸将追擒屈突通，因功授乐游府骠骑将军。
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