在司令部下面有各个空域，有空域司令官，再去下面又有各个文明的分指挥部。负责某个文明内部的军事力量。某个文明内部的军事力量，又分成文明内部战区，设有战区司令官，战区司令官下面还有集团军（兵团）群，集团军群（兵团）司令官，集团军（纵队），集团军（纵队）司令官，然后是军师旅团营连排。这样一级一级下来，没有办法，人实在太多了，为了统一行动，只能这样。文超现在就相当于是一个师长。民兵都是归文明内部的战区司令部指挥的。工作内容变动最大的就是这个文明内部战区司令部，有的只负责指挥民兵，例如阿古文明，因为现在还没有正规军。但是战区司令官依然是正规军人。其他文明的战区司令官，既指挥民兵也指挥正规军。正规军作战跟民兵有很大的不同的。正规军装备比民兵好的多。民兵由于数量多的原因，装备都比较差，毕竟每个文明的钱都不是白来的。
自由联邦的军衔儿，为大元帅（军事力量总指挥），元帅（星系级，如银河系，目前联邦没有，预留），次帅（星系内一级空域，亿级以上个文明的防区，目前联邦没有，预留），少帅（二级空域，几十万个文明的防区，目前联邦没有，预留），上将（三级空域，几百个文明的战区），大将（文明战区），中将（集团军群），少将（集团军），大校，上校，中校，少校，上尉，中尉，少尉，上士，中士，下士。如果当上大帅，那就太帅了。找几艘飞船给自己家运点儿土豆，那还不玩儿似的。军队收别人家的白菜两个联邦币一斤，收大元帅老舅家的，咋着还不得四十个联邦币。四十个联邦币，不忒好吧，怎么说您也是大帅，那就六十个好了，不能再高了，注意影响。窃笑！！元帅，一百四十一民兵加七十亿正规距就一个，当上的概率真是比流星砸中脑袋还低。军衔与职责大体对应，具体任务由上级指挥官任命。将官以上对战略负责，将官以下的指挥官对战役负责。按照联邦的均线制度，其实只有将官，也就几百个文明。但是总指挥成了大元帅，明显是要统治全宇宙，不知道有没有这个能力。没关系，反正吹牛又不上税。将官以上，每差一级，管理的人员指数级增加。目前联邦没有能力统治宇宙，尽管有元帅，次帅，少帅的军衔，也有人担任，但是没有与之对应的具体任务。元帅都干着将军的活，更多的像是一种荣誉。要想军衔高点儿，活的不别人长绝对有优势，先参个军，然后把跟你一起入伍的都熬的战死或者退休了，你就当了领导了。要熬退休别人，首先得是活的比较长的物种。如果自然寿命就不长，那就没希望了。
再说两边军队的机构。因为两边的人以前都打过交道，机构的设置都一样。军队的后勤部，负责物资的调配，运输，相当于掌管财政权。人事处负责本机军官副职和下级军官的任免，相当于掌管人事权。指挥官负责作战任务的计划，实施，相当于掌管事物权。军法处负责维持军队的纪律。后勤部，人事处，军法处都只受上级部门的领导，上级单位也负责人员的任免。但是任务由本级指挥官分配。本级指挥官，由上级人事处任免。负责任免部门负责人的部门，也负责考核自己任免的人。也就是，谁任免，谁考核。这个指挥也不是件轻松的事情，联邦里什么阶段的文明都有，石器时代的有，青铜兵器的有，热兵器的有，生化武器的有，核武器也有。造飞船的有，造不出来木船的也有。
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