如果是其他人问，又或者是其他时候，陈新甲不会说实话，以免被人听到，传到那些勋贵耳中，但现在他位置摇摇欲坠，随时都可能会被下旨论罪，又是面对太子，所以他也就顾不得那么多了，微微一思索，拱手道：“殿下，恕臣直言，我大明开朝三百年来，鼎定九边，海晏波平，卫所制曾经功不可没，但实至今日，卫所制却已经是弊端多多，不合时宜了，全国在册的卫所兵有百万余，但真正存在的连五十万都不到，能战的就更是少了，臣数次调兵而调不出，因此臣以为，要想外抗建虏，内平流贼，卫所制必须有所改变。”
陈新甲所说，并没有什么新意，但却是一种态度的展现。
而朱慈烺要的就是这种态度。
“如果朝廷整顿卫所，陈部堂，你能担此重任吗？”朱慈烺淡淡笑。
陈新甲稍微犹豫了一下，然后朗声回答：“只要陛下有令，臣赴汤蹈火，再所不辞！”
朱慈烺暗暗叹口气，看来陈新甲并没有革故鼎新的决心，非“改革”之才。
当然了，军制改革关乎大明国运，改好了，大明中兴，改不好，大明就玩完，如此艰巨的任务，确也不是陈新甲所能承担的。
“对于流贼，部堂又怎么看呀？”
朱慈烺忽然又换了一个话题。
陈新甲不明白太子的话题变化为何如此剧烈？不过他也乐意改变话题，于是朗声回答：“殿下，流贼都是乌合之众，虽然势大，但却难以成势，我大明的心腹之患仍是辽东。”
朱慈烺笑一笑，陈新甲虽然有点干才，但终究是缺乏战略眼光，如果没有李自成的帮忙，再过一百年，建虏也不可能攻破北京，在汉家江山上建立满清王朝。所以，大明的心腹之患并不是满清，而是李自成。但李自成并不是天生就是流寇，如果丰衣足食，国泰民安，鬼才愿意造反，所以归根到底，大明朝的问题还是两个字：民治。
至于建虏，只要紧守山海关，重兵屯于蓟辽，加强沿途长城要塞的防守，堵死建虏绕道蒙古侵袭大明的路径，再配合平辽三策，坚壁清野，不出五年，建虏必乱。
看来，陈新甲终究不是兵部尚书的最佳人选。
见朱慈烺忽然不说话了，陈新甲微微忐忑，难道是自己说错话了？
想要问，但又不敢问。
“陈部堂对辽东又怎么看？”
朱慈烺问。
陈新甲精神一振，辽东才是他的强项，也是崇祯任用他为兵部尚书的原因。。
陈新甲滔滔不绝的讲。
朱慈烺静静听。
没有什么新奇的，无非就是扼守关隘，烽火示警，辽人守辽，空话大话一堆，没有提出一个有用实际的策略。
最后，陈新甲终于说到一个还算有用的策略。
那就是彻底关闭马市，不使一粒粮食，一斤生铁流入建虏。
这也是朱慈烺向父皇提出的建议之一。
不过朝堂之上却有朝臣提出异议，蒙古人虽然向建虏臣服，但因为有马市的存在，所以他们并没有全力帮助建虏，一旦断绝马市，就等于是彻底将他们推到了对立面，为了得到粮食和布匹，他们必然也要兴兵寇边，到时，建虏在山海关蓟辽，蒙古人在宣大，两路夹击，以朝廷现在的兵力，必然是左支右绌，无法应对。
再有，一旦关闭马市，朝廷的战马从何而来？没有战马，朝廷又何以剿灭流寇，收复辽东呢？
所以，彻底关闭马市之策在朝堂上讨论了好几次，始终没有定论，最后采取折中之策，决定缩小马市规模。
明末最大的问题就是官员短视，相互扯皮，蒙古人既然向建虏臣服，就已经是大明的敌人了，又怎么能奢望他们看在马市的份上，跟建虏三心二意，不全力帮助建虏呢？
而崇祯也被朝臣们唬住了，这么明显的事情，竟然也下不了决断。
朱慈烺心里有火气，但他是太子，不是皇帝，朝政大策终究还是要听父皇的。
“蒙古人不足虑，他们已经安逸一百年了，没有建虏坚持，他们绝对不敢单独寇边，宣大府的精兵对付不了建虏，但对付他们还是不成问题的。”陈新甲说。
朱慈烺点点头：“但精兵需要良将，我忧心的是，曹文诏曹变蛟之后，我大明已经没有良将了……”
“殿下过虑了，我大明富有天下，英才辈出，只要悉心选拔，岂能没有良将？”陈新甲安慰。
朱慈烺沉思了一下，说：“刘肇基倒是一员良将，可惜负罪在家。”
刘肇基，明末抗清名将。崇祯十三年，任辽东副总兵，与曹变蛟等人合兵击清军于塔山、松山，并率士卒千余人救吴三桂于杏山，但被人诬以临阵退却，被督师洪承畴罢官免职，历史上，一直到崇祯十七年，刘肇基自请从征效力，才被朝廷重新起用，得加授左都督、太子太保衔。
1645年3月，清军包围扬州，史可法命附近驻军增援，只有刘肇基一支孤军赶到，入城守北门，城破之后，刘肇基率部400人与清兵死战，格杀数百人，终寡不敌众，最后全军覆没，副将乙邦才、马应魁、庄子固等皆同死。
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