与此同时，第一波空袭中途岛返航的飞机，已经陆续飞抵南云舰队的上空，在母舰周围盘旋，焦急地等待着降落的信号，他们的油料即将耗尽！而美军的鱼雷机部队，也已经像闻到血腥味的鲨鱼一样，开始对南云的舰队发动了第一波自杀式的攻击！
在各种相互矛盾的信息、来自不同参谋的混乱建议、以及战场瞬息万变的巨大压力之下，南云忠一，这位在偷袭珍珠港时还显得沉着冷静的指挥官，此刻似乎也方寸大乱。他犹豫不决，举棋不定，错失了在第一时间做出正确决断的宝贵机会。最终，他做出了一个在当时看来似乎是“最稳妥”（为了回收宝贵的飞行员和飞机，也为了能组织一次更有效的反击）但事后被证明是“最致命”的决定：优先回收那些从中途岛返航的、油料即将耗尽的飞机！然后再将甲板上待命的飞机，重新改装反舰武器，组织对已被发现的美军航母发动攻击！
这个决定，虽然在程序上似乎合乎逻辑，但也导致了一个灾难性的后果——那就是在日本航母的飞行甲板上，出现了一段长达近一个小时的“致命空窗期”！在这段时间里，四艘日本航空母舰的甲板上，到处都是正在降落、加油、重新挂弹的飞机，根本无法起飞战斗机进行有效的空中警戒和护航，更无法立即组织起有效的反击力量去攻击美军航母。飞行甲板上，到处是加满了油的飞机、堆积如山的炸弹和鱼雷、以及暴露在外的航空汽油输油管线……整个航空母舰，就像一个巨大的、塞满了易燃易爆物的火药桶，只需要一颗小小的火星，就可能引发一场毁灭性的灾难！
暴风雨前的死寂（上午10:15左右）：
美军三个鱼雷机中队的悲壮攻击，虽然未能对日军航母造成任何实质性的损伤，但也成功地将日军的注意力完全吸引到了低空。南云的四艘航空母舰，在经历了美军鱼雷机轮番的“自杀式”攻击之后，毫发无损地在海面上继续航行。日本的“零式”战斗机，正在得意洋洋地在低空追逐和“打扫”那些试图逃离的、零星的美国飞机，很多战斗机的油料和弹药也即将耗尽，准备返航降落，补充给养。
南云忠一终于长长地舒了一口气。他可能觉得，最危险的时刻已经过去，美军的攻击也不过如此嘛，雷声大雨点小。他立刻下令，各航空母舰抓紧时间，回收所有返航的飞机（包括那些从中途岛返航的飞机和刚刚在低空拦截完美军鱼雷机的战斗机），并以最快的速度为第二攻击波的飞机换装鱼雷和穿甲弹，准备对已被发现的美军航空母舰发动致命一击！他相信，胜利的天平，依然牢牢地掌握在自己手中。
此时此刻的日本航空母舰甲板上，呈现出一片忙碌而又“生机勃勃”的景象：地勤人员像工蜂一样，推着沉重的炸弹和鱼雷在甲板上来回穿梭；一架架刚刚降落的飞机被迅速拖到升降机旁，送入机库进行加油和检修；而那些即将参加第二波攻击的飞机，则被重新推到飞行甲板的前端，准备再次出击。发动机的轰鸣声、地勤人员的吆喝声、金属工具的碰撞声……交织在一起，仿佛预示着一场对美国舰队的毁灭性打击，即将在几十分钟后，准时上演。
悬念与转折的铺垫：
然而，就在这看似日军即将掌控全局、胜利在望的“黄金时刻”，在高高的云层之上，命运的无形之手，已经悄然拨动了胜负的指针。一群被日军完全忽略的、也几乎被美军鱼雷机部队那悲壮的牺牲所掩盖的美国飞机，正凭借着飞行员们惊人的毅力和一点点令人难以置信的运气，像一群复仇的鹰隼，向着这个即将爆发巨大威力的“火药桶”，悄然逼近……
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